Corebio Paca - Coordination des plates-formes technologiques en sciences du vivant en PACA

Génomique Fonctionnelle (Nice Sophia Antipolis)

(Pascal BARBRY)

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-Toute mesure sur puces commerciales (lames de verre type Agilent ou Affymetrix) : mRNA, microRNA, SNP, CNV. -Séquençage haut débit sur SOLiD (Applied) : petits ARN, ARNm, ChIPseq -Support bioinformatique et aide à l'interprétation -Archivage des données et aide à la publication en ligne (GEO, ArrayExpress)

Une expertise et un savoir-faire au service des laboratoires et industriels

Des équipements performants
- SOLiD5500XL (Applied)
- Serveurs LINUX et postes de travail. Constitution progressive du parc depuis octobre1999
- Station Affymetrix + scanners lames de verre
- Robot Biorad SDDC2 de production des puces à ADN (INRA Biot)
- qPCR (x2)
- Tetrad MJ Research 01/01/2002

Exemples de réalisations académiques

- Tissuthèques CHU Nice (Pr Paul HOFMAN)
- Laboratoire Didier RAOULT (La TIMONE)
- Laboratoire Monsef BENKIRANE (Montpellier)
- Equipe Meyling Cheok (INSERM Lille)

http://www.genomique.info http://www.france-genomique.org/

Institut de Pharmacologie Moléculaire et Cellulaire

Organismes
et/ou structures d'appartenance :

CNRS, Université de Nice Sophia Antipolis

Nos clients

Communication des partenaires industriels non possible (contrats de confidentialité)

Secteurs d'activité

Analyse du transcriptome

Mots clés

Puces à ADN/ DNA micro-arrays, RT/RQ-PCR

Outils informatiques propriétaires

Système d'Information Mediante et outils d'interprétation associés (Le Brigand et Barbry, Bioinformatics, 2007,2010). Gestion de toutes les informations relatives à l'analyse et à l'interprétation des profils d'expression, ainsi qu'au séquençage haut-débit.

Contacts

04 93 95 77 93 (admin: Cécile Larédo) - 04 93 95 77 90 (wetlab: Virginie Magnone / Géraldine Rios)

Institut de Pharmacologie Moléculaire et Cellulaire
CNRS & UNSA UMR6097
660, route des lucioles
06560 Sophia Antipolis - France