MicroBioGénomique
(Didier RAOULT - Michel DRANCOURT)
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Plateforme MicroBioGénomique
- Recherche fondamentale : Génomique et post-génomique des pathogènes émergents : perspective évolution des microorganismes. - Recherche appliquée : Génomique des pathogènes hautement contagieux/hautement résistants/bioterrorisme - Analyse du génome de 24 microorganismes (1er virophage, 1er gros virus à ADN et plusieurs bactéries intracellulaires strictes, pathogènes)
Une expertise et un savoir-faire au service des laboratoires et industriels
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Des équipements performants
Proséquenceur Roche Titanium, Séquenceur à capillaires ABI 3130, BioAnalyzer Agilent, Compteur Z2 Beckman, TissueLyser Qiagen, Automate de digestion des spots, Agilent Microarray scanner, Maldi-Tof, spectrotomie de masse
Exemples de réalisations académiques
collaborations régionales, nationales (Université, CNRS, INSERM, CEA, Services hospitaliers) et internationales
Unité des Rickettsies - Université de la Méditerranée
Organismes
et/ou structures d'appartenance :
Marseille Nice Génopôle Université de la Méditerranée
Nos collaborations
Unités CNRS, CEA_Génoscope, Universités étrangères ( ex : Suisse )
Secteurs d'activité
Génomique et Post-Génomique Haut-débit des Pathogènes Humains
Mots clés
Séquençage, Post-génomique, Bactérie, Virus, Pathogène
Outils informatiques propriétaires
Assemblage de génomes : GsAssembler, CLC, Velvet Annotation, Acquisition et visualisation de spectres, identification des bactériennes
Contacts
Catherine ROBERT
Tél : 04 91 32 44 66
Email : catherine.robert@univ-amu.fr
Unité des Rickettsies - CNRS - UMR 6236
Faculté de Médecine de la Timone
67, Boulevard Jean Moulin
13385 Marseille Cedex 05
France