Plateforme Transcriptome PETC (CHU Nice / INSERM)
(Ghislaine BERNARD)
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Analyse du transcriptome
La Plateforme d'Etude du TransCriptome (PETC) est un outil décisif pour l'exploration clinique et/ou fondamentale.
La plateforme dispose de plus de 1800 gènes humains (18 plaques thématiques) et de 1000 gènes murins (10 plaques thématiques) d'intérêt en immunologie, immunogénétique, cancérologie, hématologie, infectiologie, pharmacologie, …
APPLICATIONS en qPCR
- Détection / Quantification de microorganismes (bactéries, virus, parasites)
- Quantification d’OGM
- Etude d’expression génique : entre différents tissus, impact de différents traitements (monitoring), aberrations chromosomiques (duplication/délétion de gènes)
- Validation de siRNA
- Etude de polymorphisme : SNPs (single nucleotide polymorphisme), Chimérisme
- Expression protéique : immuno qPCR
LES PLAQUES THEMATIQUES HUMAINES
Chemokines & Receptors ; Cytokines & Réceptors ; Cell Types - Inflammation ; T / Antigen Presenting Cells ; Adaptators - Kinases - Phosphatases ; Transcription factors ; Apoptosis ; Cytoskeleton ; Transendothélial Migration ; Autophagy ; Foxo ; P53 ; Immunity Innate ; Ubiquitin-Protéasome ; Inflammasome ; ExtraCellular Matrix ; Télomere & Telomerase * ; Growth Factors*
LES PLAQUES THEMATIQUES MURINES
Chemokines & Receptors ; Cytokines & Réceptors ; Cell Types - Inflammation ; T / Antigen Presenting Cells ; Adaptators - Kinases - Phosphatases ; Transcription factors - Growth - Apoptosis ; Osteogenesis ; Cytoskeleton ; Natural Killer ; Miscellaneous
Une expertise et un savoir-faire au service des laboratoires et industriels
Nos prestations de services technologiques
P1 : plaques thématique de l'U576
P2 : plaques à façon
P3 : plaques préparées au préalable par le demandeur hors de l'unité 576
P4 : distribution de primers pour plaques thématiques U576
Normalisation des cDNA
Reverse Transcription
Extraction d'ARN et d'ADN
Des couples d'amorces et de sondes spécifiques peuvent être dessinés à la demande et validés. En effet, la plateforme est ouverte à tous les thèmes de recherche en biologie et santé.
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Des équipements performants
- Pièce confinée dédiée à la qPCR
- 1 appareil de qPCR ABI Prism 7900ht (Applied Biosystems)
- Blocs pour plaques96, 96Fast, 384 et TLDA
- 1 automate BiomekNX multichannel (Beckman Coulter)
- Une hotte Captair
- Un thermocycleur
- Une centrifugeuse pour plaques et TLDA
- Gene Amp 5700 (PerkinElmer)
- Un NanoVue
Exemples de réalisations académiques
INSERM (U891 D OLIVE ; U 1065 P. AUBERGER ; U 634 G. PONZIO, R. BALLOTTI ; U 891 C. CHABANNON) ; INSTITUT PASTEUR TUNIS ; INSTITUTO ORTHOPEDICO RIZZOLI
Exemples de réalisations industrielles
Tx-Cell
PiLeJe
CHU NICE / INSERM
Organismes
et/ou structures d'appartenance :
CHU Nice / INSERM
Nos clients
Tx-Cell
PiLeJe S.A.
P. Doglioli (Fondation Sophia-Antipolis)
Nos collaborations
S. Chouaib (INSERM U753, IGR, Villejuif)
P. Auberger (équipe 1, U1065, C3M)
S. Tartare Deckert ((équipe 11, U1065, C3M)
J. Chabry (UMR CNRS-UNS 7275)
J.E. Ricci (équipe 3, U1065, C3M)
E. Van Obberghen (UMR 6543)
P-M. Roger (Recherche Clinique - CHU Nice)
Secteurs d'activité
Analyse du transcriptome
Mots clés
RT-qPCR
Contacts
Nadège GONTHIER
Tél : 04 92 15 77 07
Emai l: Nadege.Gonthier@unice.fr
Hôpital de l'Archet 1
Route de St Antoine de Ginestière, BP 3079
Nice cedex 3
